בדיוק כמו בספר "דירה להשכיר" של לאה גולדברג, שעל שמה נקרא מרכז מטאור, כך גם מבנה המרכז בן 5 קומות:

בקומת הקרקע – מרכז גילוי מדעים לגיל הרך. אליו מגיעים ילדי גנים רחבי הרצליה. הילדים לומדים וחוקרים מדעים באמצעות סדנאות ייחודיות, עריכת ניסויים, חדרי דמיון, מתקנים שהובאו במיוחד מהמדעטק, פעילות בחצר חוקרת, הפעלות גוף ותנועה, ועוד.            המרכז מקדם את העיסוק בתחום המדעים, הטכנולוגיה וחקר החלל כבר מגיל הגן – דבר ייחודי בארץ.

בקומה הראשונה – מרכז חוגים וקהילה. בין החוגים שפועלים גם לילדים וגם למבוגרים ניתן למנות: מדע וטכנולוגיה, לימוד שפות, מחול ותנועה, התעמלות, תיאטרון, אמנות, קפוארה ועוד. כמו כן ישנם במרכז חוגים ופעילויות קהילתיות ייחודיות גם לתושבים הוותיקים.

בקומה השנייה – 
מועדון השחמט הרצליה ע"ש אריה אוריאלי עבר למרכז מטאור במקום משכנו ברחוב הס והוא גדל והתפתח משמעותית. במועדון מתקיימים טורנירים ותחרויות בינלאומיות מול קבוצות מחו"ל באמצעות לוחות אלקטרוניים משוכללים ומתקדמים שהוצבו בו, לצד חוגים ופעילויות שח לילדים. בנוסף, איגוד השחמט יקיים תחרויות ארציות וחוגים, ובהמשך ייפתחו סדנאות ייחודיות שיעסקו בנושאי מיומנויות ניהוליות גבוהות באמצעות משחק השחמט – בשיתוף חברות עסקיות ואוניברסיטאות.

מרכז הקיימות עוסק בנושאים של קיימות עירונית וגלובלית בהיבטיו השונים. התושבים יכולים ליהנות מסיור אינטראקטיבי בחלל מוזאלי מיוחד, כמו כן, יתקיימו בו סדנאות מייקרס בשילוב עירוב חושים, סדנאות "קפה תיקון", חידוש רהיטים, אמנות ממוחזרת, בגדי יד שנייה ועוד. בנוסף במרכז קיימת מעבדה דמוקרטית עירונית שמהווה מפגשי שיתוף ציבור בנושאים עירוניים מגוונים ופעילויות משותפות עם המגזר העסקי, האקדמי ואזרחים ותיקים.

בקומה השלישית והרביעית – בית ספר "שחפים" למחוננים ומצוינים ע"ש אהרון ידלין ז"ל. בבית הספר כ-100 תלמידות ותלמידים שזוכים לחוות פעילויות העשרה מגוונות בתחומי מדעים, טכנולוגיה, מחשבים, פילוסופיה ועוד.